Povodí Moravy provádí na přerovském jezu každoroční srážku hladiny, která potrvá do pátku 30. července. Vodohospodáři díky snížení hladiny mohou provádět kompletní prohlídku a servis jezové konstrukce, kontrolu břehového opevnění v nadjezí a především rozhrnutí štěrkových lavic, které snižují průtočnost koryta řeky. Přemístěné nánosy z Bečvy pak budou při vyšších průtocích přirozeně transportovány dále po toku, kde budou znovu sedimentovat. Podle tiskového mluvčího Povodí Moravy Petra Chmelaře jde o léty osvědčený systém preventivní ochrany města před jarními ledochody.

Pravidelná údržba zařízení jezu a jeho částí probíhá v Přerově pravidelně každým rokem v tomto období.  Přerovský jez slouží k zadržování a vzdouvání vody. Z nadjezí probíhá odběr vody pro průmyslové využití. Vzdutá hladina umožňuje v intravilánu Přerova rekreační využití celého nadjezí, provozování plavby, vodních sportů a dalších aktivit. Jez slouží ke stabilizaci sklonových poměrů řeky Bečvy v městském úseku toku a toku pod jezem.